Según establece la DMA, una masa de agua no puede ser catalogada en buen estado ecológico, y por tanto en buen estado, si las condiciones físico-químicas no alcanzan una situación que asegure el buen comportamiento de los ecosistemas.
La DMA establece, en su anexo V, entre los indicadores químicos y físico-químicos que afectan a los indicadores biológicos, los siguientes:
• Generales
Condiciones térmicas
Condiciones de oxigenación
Salinidad
Estado de acidificación
Condiciones relativas a los nutrientes
• Contaminantes específicos de la cuenca
• Otras sustancias contaminantes intervienen en el cálculo del estado a través del denominado Estado Químico, que se trata en otra sección.